Výzkumná a odborná činnost Katedry environmentálního inženýrství je zaměřena do následujících oblastí:
podrobný ekologický průzkum recentních forem posttěžebních oblastí (fytocenologické mapování a hodnocení vývoje vegetačního krytu),
studium oživení poklesových kotlin a technologických nádrží v oblastech dobývání nerostných surovin (biosorpce, monitoring povrchových vod, biologické čištění důlních vod, půdní semenná banka poklesových kotlin, studium kvalitativní, kvantitativní, časové a funkční struktury společenstev fytofilních bezobratlých),
vývoj a návrh nových technologií pro obnovu posttěžebních oblastí,
revitalizace říčních systémů,
krajinné a územní plánování, lokalizace Brownfields,
vlivy průmyslových technologií na životní prostředí,
posuzování vlivů termických metod (zejména pyrolýzních) energetického využití odpadů na životní prostředí,
posuzování vlivů na životní prostředí (EIA),
technologie úpravy vod a čištění odpadních vod (čiření, flokulace, filtrace, flotace, flotoflokulace, membránové procesy a další),
vlivy odpadů a průmyslové činnosti na ŽP a možnosti jejich eliminování,
kaly z bioplynových stanic jako možný zdroj živin kulturních plodin,
hodnocení půdních, geologických a biologických poměrů,